В процессе любого сгорания возникают водяные пары; в традиционных котлах они уходят в атмосферу вместе с продуктами сгорания. В итоге энергия, заключенная в этих водяных парах (так называемое латентное и физическое тепло), теряется и в отоплении не участвует. В конденсационных котлах значительная часть водяных паров конденсируется из-за охлаждения. Освободившееся при этом тепло используется для отопления. Конденсационные котлы расходуют энергию топлива намного полнее традиционных, соответственно снижается расход газа. Котел с двадцатилетним сроком службы позволяет экономить до 40% газа. Необходимо, однако, обязательно соблюдать некоторые правила: точно рассчитывать параметры новой или обновляемой системы отопления и отвода продуктов сгорания и конденсата. В отопительной системе нужно выбирать увеличенную площадь радиаторов, из чего следует, что в возвратном трубопроводе будет понижаться температура воды. Преимущества конденсационного котла лучше всего проявляются в использовании возникающего высокого температурного градиента. Его эффективность зависит от температуры в возвратном трубопроводе. Отопительную систему с конденсационным котлом надо проектировать в низкотемпературном варианте. В этом случае в системе нельзя применять четырехходовую смесительную арматуру, термостатические головки, переключаемые распределительные устройства и коллекторы, кроме того, систему нельзя закорачивать жестким или насосным переключением.

Очень важен выбор подходящего дымохода. В конденсационных котлах используются качественные нержавеющие материалы, например антикор, стекло, глазурованная керамика, специальные пластмассы и т.д. Дымоход всегда должен быть снабжен вентилятором, поддерживающим выпуск продуктов сгорания, так как очень низкая температура отрицательно влияет на физические параметры тяги. Если в самом котле вентилятор не предусмотрен, подбирают подходящий тип для дополнительной установки. Важную роль играет отвод конденсата, у которого значение рН доходит до 4,8, причем за час непрерывной работы котел мощностью 20-25 кВт производит 2-2,5 л конденсата. Специальный вспомогательный трубопровод выводит его в подготовленную сливную канализацию или в яму. Котел мощностью до 25 кВт можно подключать к канализации без дополнительных мер, у котлов мощностью свыше 25 кВт конденсат ночью собирается в отстойник, а затем сливается вместе с фекальными водами, или же осуществляется нейтрализация конденсата. У котлов более высокой мощности нейтрализация обязательна.

При реконструкции старых отопительных систем и установке конденсационного котла рекомендуется применять самосплавные системы с большим содержанием воды. Эти системы часто рассчитывают с избыточными параметрами, поэтому они подходят для низкотемпературной эксплуатации. Однако и в этом случае следует выполнять обязательные условия эксплуатации конденсационных котлов (отвод продуктов сгорания и конденсата), а сами системы не подлежат дополнительным изменениям (нельзя использовать четырехходовую арматуру, термостатические головки и т.д.). Вопреки всем преимуществам конденсационной техники итоговый эффект не всегда бывает оптимальным.